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质粒提取常见问题解答

1. QG8140 绿色荧光核酸染料(10000×)  染色,条带不亮是为什么?

A:绿色荧光核酸染料特别适合于大片段 DNA 的检测(大于 1kb 的片段,检测灵敏度与 EB 相当);当 DNA 片段小于 1kb ,检测灵敏度低于 EB,特别是低于 500bp 的片段绿色荧光核酸染料可能亮度很弱或检测不到.如果检测小片段的 DNA,请选用G8142,该染色剂适合于检测所有片段大小的 DNA 片段。

一般的,100mL胶加10微升染料,如果觉得荧光较弱,可适当增加染料用量。

 

2. Q:使用G8142 GoldView II 核酸染料 进行1%琼脂糖凝胶电泳,胶回收PCR产物时,电泳结果显示MARK和目的条带均不清晰,呈弥散状,后续实验无法进行。

A:使用时,请将商品化的 Marker 用 1×DNA Loading Buffer 作 5-10 倍的稀释,上样 1-10µl, 以得到较好的结果(通常稀释 10 倍后上样 5ul)。对于待检测样品,通常仅需 1-2µl 即可。如果浓度较高,也须作一定倍数稀释,否则会造成条带不整,影响迁移速率。凝胶回收请选择点染方法。

 

3. Q:提取量不够?

A:一般的,增加样本量是Z简单的方法。此外,吸附膜的主要原理是低温结合、高温洗脱。因此,在吸附柱静置时,放在结合3-5min,再重新吸附一次,通过增加结合次数达到提高提取量的目的。如果提取的质粒较小或拷贝数很低,可以在吸附那一步适当加入少量的1/5-1/3的异丙醇,提高回收率(一般不建议)

 

4. QD1140 提取量有多少?

A:因质粒拷贝数的差异性,不一定能够上百。

 

5. Q:有专门用于提取质粒的柱子吗?

AN1010N1011-A都可以

 

6. QN1011-B 可以用于提取质粒吗?

A:不可以。只能用于提取基因组,提取质粒会造成质粒虚高。

 

7. QN1010 系列的柱子,可以容纳多少体积溶液?

A650-700微升左右

 

8. Q提取出的质粒用于测序,可以用你们的洗脱缓冲液吗?

A:可以的,一般情况下影响不大。如果不放心,可以换用无菌ddH2O洗脱。

 

9. Q提取质粒后,做转化,转不出来?

A:一般优先怀疑感受态,若确认感受态没问题,再检测是否用错抗生素或是操作中有问题。如果确认是质粒的原因,可加大转化质粒的用量(一般的,质粒转化仅需1微升左右(质粒浓度在500ng/ul左右),若质粒浓度很低(小于100ng/ul),可以将质粒用量提高至10微升)

10. Q提取出的质粒,PCR没有条带?

A1.检验引物是否适用;2.检验程序是否合适;3.检验自己操作过程中是否有问题;4.质粒浓度不可太高(一般PCR的质粒浓度在50-100ng/ul之间)

 

11. Q:转化质粒是,可以加抗生素吗?

A:可以的,不会影响质粒转化效率。

 

12. Q:没有提出任何质粒?

A:1.菌体老化(重新转化或活化菌株)?2.裂解不充分;3.菌体中真的无质粒;4.检查试剂盒中的试剂有无出现沉淀;5.加洗脱液时,没有加到吸附膜上或加的体积太少

 

13. Q:提出的质粒PCR、酶切鉴定中有一个有问题,能用吗?

A:不能。

 

14. QP3110 pET-28a+) 跑胶检测 质粒大小和说明书上大小不一致。

A:如果想要跑胶检测质粒大小,需要先将质粒进行单酶切,将质粒变为线性的再进行跑胶鉴定。超螺旋或是开环状态的质粒都无法表示质粒的大小。如果客户不认可单酶切结果,可以直接测序检测。

 

15. QR1030 RNase A溶液(10mg/ml ) 使用RNase A从大肠杆菌中提质粒,质粒溶液中的 RNA没有去掉。

ARNase A溶液 工作浓度是200ug/ml  ;而客户这边10ug/ml  建议增大用量。

 

16. Q:质粒没有被内切酶切割?

A1.酶活低,可以延长时间或是用量;2.质粒和酶活不匹配,优化酶切条件;3.质粒不纯,含有SDS,酚,EDTA等内切酶抑制因子;4.质粒上的酶切位点突变了;5. DNA不存在该酶识别顺序;6.buffer和酶不匹配

 

17. Q16.质粒酶切不全?

A1.酶活低,可以延长时间或是用量;2.质粒和酶活不匹配,优化酶切条件;3.没有混匀酶切体系;4.buffer和酶不匹配

 

18. QDNA片段数目多于理伦值?

A1.内切酶星状活性;2.其它内切酶污染:换一支新的酶或buffer3;底物中含其它DNA杂质:重新提质粒

 

19. Q:跑胶检验时,条带拖尾,模糊?

A1.浓度过高;2.盐离子高;3.有蛋白污染;4.降解了;5.换新的电泳液

 

20. Q4.Q:那个柱子可以用于胶回收?(质粒提取、胶回收、基因组、PAGE凝胶回收的试剂盒中的柱子)

A: N1030 离心式过滤柱,主要用于过滤碎胶等较大的杂质

   N1010/N1012/N1011-A 可用于胶回收(质粒、片段等)

   N1011-B  主要用于提基因组,不用于提质粒(会虚高)

 

21. Q:质粒提取类试剂盒中,所有的酶都是单发的吗?

A:是的。因为一般都要-20保存。所以不放在试剂盒里。以附件形式单发(冰盒/冰袋)

 

22. QSN0020 细胞核提取试剂盒  小鼠肝脏组织,匀浆后离不下去。

A:加热一下,让溶液不要那么粘稠。

 


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